Фамилия Ваинер, вероятно, является фонетическим вариантом фамилии Вайнер (в немецком написании Wainer или Weiner). Эта фамилия образована от аналогичного прозвища, которое в переводе с немецкого означает «тележник» - мастер по изготовлению или ремонту телег. Таким образом, это прозвище относится к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности предка. По другой версии, фамилия Вайнер является фонетическим вариантом фамилии Винер, которая переводится как «житель Вены». Также возможно, что фамилия Ваинер имеет еврейское происхождение и образована от прозвища Вайнер, что в переводе с идиша означает «виноторговец».