Фамилия Вахновские — это типичный пример родового именования, образованного от названия местности, откуда был родом основатель рода. В основе лежит топоним, а сама фамилия отвечает на вопрос «чьи?» или «откуда родом?», указывая на принадлежность к определённому селению или роду, владевшему им.

Скорее всего, предки носителей фамилии Вахновские были выходцами из одного из двух украинских селений: деревни Вахновка в Винницкой области или села Вахновцы в Хмельницкой области. Такая модель образования — от названия села с помощью суффикса -ск- — была характерна для польской шляхты и украинской старшины, чьи фамилии затем закрепились у потомков крестьян и мещан.

Сами топонимы Вахновка и Вахновцы, вероятно, восходят к личному имени Вахно. Это имя могло быть уменьшительной формой сразу нескольких крестильных имён: Варфоломей (от арамейского «сын вспаханной земли»), Вахтисий (персидское «счастливый») или Василий (греческое «царь, властитель»). В таком случае основателем селения мог быть человек по имени Вахно.

Есть и другая, менее вероятная версия: прозвище Вахно могло произойти от слова «вахня» (или «вахна») — так называют рыбу семейства тресковых. Однако в условиях Подолии (территория Винницкой и Хмельницкой областей) рыболовное прозвище в основе названия села — случай редкий, поэтому версия с крестильным именем выглядит убедительнее.

Родственные именования фиксируются в документах с XVII века: Иван Вахня (томский конный казак, 1649 г.), Ивашко Вахна (1684 г.), крестьянин Митрофанко Иванов сын Вахнев (1623 г.). Эти записи показывают, что основа «Вахн-» была в ходу у разных сословий.

Фамилия Вахновские — не единичная: к тому же корню восходят однокоренные фамилии Вахнов, Вахнин, Вахнюк. Форма на -ские указывает на более позднее, «географическое» происхождение, когда фамилия закреплялась за целым родом, владевшим или жившим в определённой местности.