Фамилия Вахновский — типичный пример фамилии, образованной от географического названия с помощью суффикса -ский. Такие фамилии в основном принадлежали дворянам (указывали на владение поместьем) или выходцам из соответствующих мест, которые получали прозвище по названию родного села или города.

В основе фамилии лежит топоним Вахновка (деревня в Винницкой области Украины) или Вахновцы (село в Хмельницкой области). Оба названия, скорее всего, произошли от личного имени или прозвища Вахно. Само имя Вахно — это уменьшительная форма от нескольких крестильных имён. Самое вероятное — от Варфоломей (арамейское «сын вспаханной земли»), реже от редкого имени Вахтисий (персидское «счастливый») или от Василий (греческое «царственный»). В народной среде такие сокращения были обычны: Вахно звучало короче и привычнее, чем полное церковное имя.

Менее распространённая версия связывает прозвище Вахно с рыбой вахня (дальневосточная треска). Эта гипотеза слабее: ареал бытования фамилии — западные регионы (Украина, Беларусь), где эта рыба не водится, да и прозвища по рыбам для людей редки.

Исторические документы фиксируют родственные имена без географической привязки. В 1649 году упоминается Иван Вахня — томский конный казак. В 1684 году — Ивашко Вахна. А в 1623 году — крестьянин Митрофанко Иванов сын Вахнев с реки Камы. Эти записи показывают, что основа Вахн- была распространена в разных слоях населения, но фамилия Вахновский закрепилась именно за теми, кто был связан с конкретным селом Вахновка или Вахновцы.

Таким образом, носитель фамилии Вахновский — это, скорее всего, потомок человека, который либо владел землёй в указанных селениях, либо, что чаще, переехал оттуда и получил прозвание «Вахновский» (то есть выходец из Вахновки).