Фамилия Вакина образована от имени Вака — просторечной, разговорной формы таких крестильных имён, как Валентин, Валерий или Валерьян. Все три имени восходят к латинскому корню valeo — «быть сильным, здоровым, могучим». В народной среде полные церковные имена часто сокращали и «обкатывали» до коротких и удобных в быту вариантов: Вака, Валя, Валерка. Именно такое обиходное имя, скорее всего, и закрепилось за основателем рода.

По словообразовательной модели фамилия Вакина относится к типичному для русских фамилий патрониму на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Вакин, то есть сын или потомок Ваки. Женская форма Вакина возникла как естественное грамматическое изменение при передаче фамилии по женской линии или при фиксации в документах на женщину.

Судя по тому, что в основе лежит не полное календарное имя, а его просторечный вариант, предки носителей фамилии принадлежали к простому сословию — крестьянам или посадским людям. В дворянской и купеческой среде предпочитали полные формы имён, а усечения вроде Вака были распространены именно в народной среде.

Интересно, что имя Вака могло быть и самостоятельным прозвищем, не связанным с Валентином или Валерием. В некоторых говорах «вакать» означало «говорить невнятно, мямлить» или «издавать звуки, похожие на блеяние». В этом случае прозвище Вака могло характеризовать манеру речи или поведения человека. Однако в контексте фамилии Вакина версия с происхождением от крестильного имени выглядит убедительнее, так как прозвищная основа «вак-» встречается реже, чем производные от популярных имён.

Фамилия Вакина — не частотная, но устойчиво встречается в центральных регионах России, особенно в бывших вотчинах и сёлах, где велась интенсивная запись крестьян в метрические книги. Географически она тяготеет к Поволжью и северо-западным областям, что косвенно подтверждает её крестьянское происхождение: именно там активно использовали сокращённые формы имён в документах XVIII–XIX веков.