Основой фамилии Вакий послужило аналогичное имя. Имя Вакий представляет собой просторечную форму одного из имен: Валентин, Валерьян или Валерий. Все эти имена имеют латинское происхождение и восходят к одной основе со значением «сильный, здоровый».