Фамилия Ванатовская — женская форма, образованная от мужской Ванатовский. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Ваната. У этого имени есть два основных объяснения, и оба заслуживают внимания.

Первая и самая вероятная версия: Ваната — это простонародная, разговорная форма крестильного имени Иван. Иван в переводе с древнееврейского означает «милость Божия» и было одним из самых распространённых имён на Руси. В народной речи оно дало множество производных: Иванко, Ванечка, Ванята, Ваната. Если следовать этой версии, основатель рода Ванатовских был выходцем из рабочей или крестьянской среды, где такие «домашние» формы имени были в ходу.

Вторая гипотеза связывает имя Ваната с профессиональным прозвищем. Слово «ванта» в русском языке — морской термин, означающий одну из толстых, смолёных верёвок, которые держат мачту с боков. Ванты — часть стоячего такелажа парусного судна. Соответственно, Ванатой могли прозвать моряка, такелажника или мастера, который вил такие верёвки. В этом случае фамилия указывает на род занятий предка.

Суффикс -овск- (в форме -овская) указывает на принадлежность или происхождение от человека по имени или прозвищу Ваната. Буквально Ванатовский — «сын Ванаты», «принадлежащий Ванате». Такая модель образования фамилий характерна для шляхетских родов на западнорусских землях, в частности на территории современной Украины и Беларуси. Фамилии на -ский/-цкий первоначально указывали на владельца поместья или населённого пункта, но со временем стали массовым способом образования фамилий у всех сословий.

Таким образом, фамилия Ванатовская либо ведёт родословную от человека по имени Иван, либо от моряка или канатного мастера. Окончательно установить точное время и место возникновения рода можно только на основании глубоких генеалогических исследований, включая архивные документы.