Фамилия Ванатов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Ванатов послужило церковное имя Иван. Ванат, скорее всего, представляет собой простонародную форму крестильного мужского имени Иван, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божия». Согласно другой гипотезе, Ванат — это прозвище, ведущее свое начало от слова «ванта», которое имеет значение «одна из толстых, смоленых веревок, держащих мачту с боков». Поэтому Ванатом могли называть моряка или того, кто вил такие веревки. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ванат, со временем получил фамилию Ванатов. О точном месте и времени возникновения фамилии Ванатов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ванатов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.