Фамилия Ванючка — яркий пример того, как просторечная, уменьшительно-ласкательная форма имени закрепилась в качестве официального родового прозвища. В её основе лежит имя Ваня, которое, в свою очередь, является производной формой от канонического имени Иоанн (в русской традиции — Иван). Однако ключевую роль здесь играет суффикс -ючк-, который встречается в русских фамилиях нечасто и придаёт основе отчётливый оттенок фамильярности или даже пренебрежения.

Если фамилии на -ов/-ев и -ин обычно образовывались от полных форм имени («чей сын?» — «Иванов»), то фамилия Ванючка строится иначе. Суффикс -к- в фамилиях часто указывает на то, что прозвище давалось не по отцу, а по самому человеку: его могли так назвать в быту за какой-то характер, внешность или просто в качестве шутливого обращения. Ванючка — это не «сын Вани», а сам Ваня, но названный с особой, чуть снисходительной интонацией. Такие прозвища были распространены в крестьянской и мещанской среде, где официальное полное имя соседствовало с уличным, домашним вариантом.

В ономастике подобные модели относят к так называемым «прозвищным» фамилиям, которые не успели пройти стадию патронимического суффикса. То есть Ванючка — это не «чей-то», а «кто-то», и фамилия закрепилась за ним напрямую, минуя форму «Ванючкин». Встречаются и однокоренные варианты: Ванюшкин, Ванютин, но Ванючка стоит особняком из-за редкого суффикса -ючк-, который в русских фамилиях практически не представлен (сравните с фамилиями вроде Анючка или Полючка — они единичны).

Географически фамилия Ванючка тяготеет к юго-западным регионам России и Украины, где диалектное произношение и словообразование допускали такие формы. Встречается она нечасто, что делает её хорошим маркером локальной традиции именования. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, получившими своё прозвище не по отцу, а по личному качеству или просто по привычному в семье обращению — Ванючка.