Фамилия Варгатюк — яркий пример того, как по суффиксу можно почти безошибочно определить географию предков. Окончание -юк характерно для украинской ономастики, особенно для запада страны: Волыни, Подолья, Полесья. Это патронимический суффикс, который когда-то означал «маленький» или «сын» — то есть Варгатюк буквально «сын Варгата».

Основа фамилии — прозвище Варгат. Оно восходит к слову «варга» или «варгатый». В русских говорах «варгой» называли рот, пасть, а «варгатым» — человека с большим ртом, крикуна или ворчуна. В украинском языке слово «варга» тоже имело значение «губа» или «рот», причем нередко с оттенком грубости. Таким образом, прозвище Варгат дали человеку с заметной особенностью речи или внешности — возможно, он был громогласным, любил спорить или просто обладал крупными губами.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем «варга» — так называли особый музыкальный инструмент, варган. В этом случае прозвище мог получить музыкант или мастер по изготовлению варганов. Однако для украинской фамилии, особенно с суффиксом -юк, эта гипотеза выглядит натянутой: тюркские заимствования чаще встречаются в южных и восточных регионах, а не на западе Украины.

Варгатюк — фамилия нечастая, и в дореволюционных метрических книгах она почти не фиксируется за пределами Волынской и Киевской губерний. Носители её, скорее всего, происходили из крестьянской или казацкой среды — патронимические фамилии на -ук/-юк в массе своей принадлежали простым людям, не имевшим дворянского статуса.

Если сравнивать с однокоренными, то в России встречается фамилия Варганов (с русским суффиксом -ов), а в Беларуси — Варгат (без суффикса). Варгатюк стоит особняком: он указывает не просто на предка по прозвищу, а на конкретную модель именования «чей сын?» — что было типично для украинских сел, где фамилии закрепились позже, чем в центральной России, и часто возникали прямо на глазах у писаря.