Фамилия Варисханов — одна из тех, где арабский корень встретился с русским суффиксом, но в совершенно неожиданном месте. Скорее всего, перед нами вариант фамилии Варисханов, распространённый у народов Кавказа и Поволжья, в первую очередь у татар и чеченцев. Основа здесь — арабское имя Варис (Warith), что означает «наследник» или «преемник». В исламской традиции это одно из имён, восходящих к эпитету Аллаха «аль-Варис» — «Наследник всего сущего». Вторая часть, «хан», — тюркский титул, который в составе личных имён часто служил пожеланием власти или знаком уважения. Таким образом, «Варисхан» — составное имя-пожелание вроде «наследник-властитель» или «достойный хан».

Русский суффикс -ов превратил это имя в фамилию по стандартной модели: «чей?» — «Варисханов». Такое оформление говорит о том, что фамилия возникла в среде, где русская административная система фиксировала имена инородцев, добавляя родовое окончание. Интересно, что ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: ВарисхАнов, хотя в быту возможны варианты.

Географически фамилия редкая, но её корни ведут в регионы, где пересекались исламская культура и русское делопроизводство: Дагестан, Чечня, Татарстан. Носители такой фамилии — потомки людей, которых в XIX — начале XX века записывали в метрики или ревизские сказки как «Варисхановых», закрепляя за семьёй имя основателя рода. Никакой другой, неарабской версии происхождения у этой фамилии нет: попытки связать её, например, с тюркским «варис» (в значении «человек, который варит») — это народная этимология, не выдерживающая критики. В фамилии нет ни славянского корня, ни географического названия — только имя с титулом, обрусевшее по форме.