Фамилия Варсаков — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её корень, нужно отбросить типичное окончание -ов, которое указывает на принадлежность («чей?» — сын Варсака). Основа — Варсак. Сразу заметим, что это неканоническое имя и не распространённое прозвище, что делает фамилию интересной для этимолога.

Самая вероятная версия связывает Варсака с тюркским словом «барсак» или «варсак». В ряде тюркских языков (особенно в татарском, башкирском, казахском) «барс» — это барс, снежный барс, а аффикс -ак/-сак может образовывать уменьшительные или ласкательные формы. Таким образом, Варсак могло быть прозвищем, данным за сходство с этим зверем: ловкий, стремительный, свирепый или же имеющий внешнюю черту (например, светлые с тёмными пятнами волосы). Начальная «в» вместо «б» — результат фонетической адаптации в русской среде (оглушение или влияние диалектного произношения). Подобные переходы встречаются, например, у фамилий Барсуков — Варсуков.

Вторая, менее распространённая гипотеза, выводит Варсака из крестильного имени Варсонофий (греч. «бодрый умом»). В просторечии это имя сокращали до Варса, Варсак — подобно тому, как из Пантелеймона делали Паньку. Но для такого сокращения нет устойчивой модели, и в источниках по русской антропонимике (например, в работах А. Суперанской) форма Варсак как производная от Варсонофия не фиксируется как типичная. Эта версия спорна, но полностью исключать её нельзя, особенно если фамилия бытует в среде старообрядцев, где имя Варсонофий было распространено.

Географически фамилия Варсаков тяготеет к Поволжью и Предуралью. Встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Это косвенно подтверждает тюркскую версию: регион исторического смешения русского и тюркского населения. Сословная принадлежность носителей фамилии могла быть разной — от государственных крестьян до казаков, но массового дворянского рода Варсаковых нет.

Что касается суффикса -ов, он стандартен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на согласный. Фамилия Варсаков — типичная патронимическая модель, но с нестандартной, экзотической основой. В отличие от фамилий Варламов или Варфоломеев, корень Варсак не имеет очевидного славянского или греческого источника, что и делает его уникальным маркером тюркского влияния на русскую ономастику.