Фамилия Варшона — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу указывает: перед нами не исконно русская крестьянская фамилия, а скорее всего, западное или южноевропейское заимствование, адаптированное на русской почве.

Скорее всего, основа фамилии — географическая. Наиболее вероятная версия: Варшона — это вариант фамилии Варшава или Варшавский, но в польской или белорусской огласовке. В польском языке название столицы звучит как Warszawa, а прилагательное от него — warszawski. В русской передаче через «о» после шипящего (Варшона) могла закрепиться в результате диалектных особенностей или ошибок писарей. Такие фамилии давали выходцам из Варшавы или окрестностей, особенно в XIX веке, когда многие поляки и евреи переселялись в глубь Российской империи.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с личным именем или прозвищем. В некоторых говорах «варшон» могло быть искажением имени Варсонофий (греч. «быстрый, живой») или его просторечной формы Варсон. Но это предположение слабее: следов такого прозвища в исторических документах почти нет.

Суффикс -он(а) в фамилии — нетипичный для русского языка. Он скорее характерен для украинских и польских фамилий, где -он может быть остатком суффикса принадлежности (сравните: Коцюба — Коцюбон, Варшава — Варшон). В русской среде такой суффикс не образовывал фамилий, поэтому Варшона — явный пришелец с запада.

Географически фамилия встречается в основном в западных регионах России, в Беларуси и на Украине, что подтверждает её польско-белорусские корни. Встречаются также варианты написания: Варшон, Варшоня, Варшонка. Социальный статус носителей в XIX веке мог быть разным: от мещан и ремесленников до мелкой шляхты, но точных данных о сословной принадлежности нет.

Таким образом, носитель фамилии Варшона, скорее всего, потомок человека, которого в прошлом называли «варшавянином» — либо по месту рождения, либо по прозвищу, данному переселенцу из польской столицы.