Фамилия Варшко — редкая и звучит не по-русски. Её происхождение почти наверняка связано с географическим названием Варшава, но путь, которым это название превратилось в фамилию, заслуживает отдельного разбора.

В основе лежит польский топоним Warszawa. Однако суффикс -ко не характерен для польской фамильной модели: поляки чаще использовали суффиксы -ский/-цкий (Варшавский) или -ович/-евич (Варшавский, Варшевич). Суффикс -ко, напротив, очень распространён в украинской, белорусской и южнорусской ономастике. Он выполнял уменьшительную или «сыновью» функцию — указывал на потомка или человека, связанного с местом. Таким образом, Варшко — это, скорее всего, украинская или белорусская адаптация: «тот, кто из Варшавы» или «варшавянин». Первоначально это могло быть прозвище человека, переехавшего из Варшавы в другую местность, или же его сына, которого называли Варшко («маленький варшавянин»).

Вторая, менее вероятная версия, отрывает фамилию от столицы Польши. В польском языке есть слово warsz, обозначавшее некий вид обмена или меновой торг (от старого немецкого wechseln — «менять»). Тогда Варшко могло быть прозвищем менялы или торговца, а фамилия образована по той же украинской модели. Однако эта гипотеза слаба: слово warsz в этом значении было узкодиалектным и быстро вышло из употребления, а топонимическая версия и проще, и логичнее.

Что касается географии, фамилия Варшко встречается преимущественно в западных областях Украины (Волынь, Ровенщина) и в приграничных с Беларусью районах. Это косвенно подтверждает версию о переселенцах из Царства Польского или о людях, чьи предки имели контакты с Варшавой. В России фамилия редка, чаще всего её носители — потомки выходцев с запада.

В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована — это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где польское влияние смешивалось с восточнославянской языковой традицией.