Фамилия Вартаньянтц — редкий пример армянской родовой фамилии в русской записи. Её основа — мужское имя Вартан, которое в переводе с армянского означает «роза». По другой версии, в основе может лежать близкое имя Вардан со значением «награда». Обе гипотезы возможны, но первая встречается чаще: имя Вартан широко распространено в армянской ономастике.

Ключевая особенность фамилии — её финальная часть «-янтц» (в оригинале «-янц»). В армянском языке это патронимический суффикс, указывающий на принадлежность к роду или клану. Первоначально такие фамилии отвечали на вопрос «из кого?»: Вартаньянтц буквально означало «из рода Вартана». Формант «-янтц» — это вариант более привычного «-ян» (как в фамилиях Вартанян, Петросян), но с добавлением древнего показателя родительного падежа множественного числа. В русском языке он закрепился в виде «-янтц» из-за особенностей передачи армянской фонетики.

Встречается также написание Вартаньянц — без буквы «т» на конце. Оба варианта отражают одну и ту же модель: фамилия указывает не на отдельного человека, а на весь клан. Носители такой фамилии — потомки человека по имени Вартан, который жил несколько поколений назад. Сословной привязки у фамилии нет: её могли носить и ремесленники, и священники, и воины — всё зависело от конкретной ветви рода.