Основой фамилии Варухин послужило церковное имя Варуха. В основе фамилии Варухин лежит женское крестильное имя Варуха, производная форма имени Варвара, которое в переводе с греческого означает «чужеземка». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Варуха, со временем получил фамилию Варухин.