Фамилия Венедикитов — редкий пример, когда церковное имя не просто легло в основу, а сохранило почти полную звуковую форму. В отличие от привычных Венедиктовых (с утратой гласной «и»), здесь видна более точная передача латинского Benedictus — «благословенный». В русской традиции это имя закрепилось как Венедикт, а в народном обиходе часто редуцировалось до Веденея или Ведищева. Фамилия Венедикитов фиксирует полный вариант, что может указывать на книжное, грамотное происхождение — возможно, её первым носителем был человек, связанный с церковной средой, где имя произносили строго по уставу.

Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от полных форм канонических имён: он отвечает на вопрос «чей?», то есть Венедикитов — сын Венедикита. Интересно, что в основе лежит не стандартное Венедикт, а разговорная форма Венедикит, с ударением на втором «и». Такое произношение встречалось в северных и центральных губерниях, где гласные в церковных именах могли смещаться под влиянием местных говоров.

В документах XVII–XVIII веков эта фамилия почти не встречается — её вытесняли более простые варианты вроде Венедиктов или Веденев. Венедикитовы могли быть либо священническим родом, где имя писали «по-книжному», либо выходцами из старообрядческой среды, где ценили точное следование дониконовским текстам. Сейчас фамилия крайне редка: по данным современных исследований, её носители в основном сосредоточены в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает связь с зонами расселения староверов.

Ошибочно связывать фамилию с растением венедикт (чертополох) — это народная этимология. Корень исключительно антропонимический, и никакого «растительного» значения у неё нет.