Фамилия Вердникова — женская форма фамилии Вердников, и её происхождение напрямую связано с тем, кем был первый носитель мужской версии. В основе фамилии лежит прозвище или профессия, и здесь есть две основные версии, и одна из них заметно убедительнее.

Самая вероятная версия отсылает к слову «вердник». В диалектах русского языка, особенно в северных и уральских говорах, вердником могли называть человека, занимающегося вердой — так в некоторых местах именовали вершу, рыболовную снасть из прутьев. Соответственно, Вердников — это потомок рыбака, который ставил верды, или мастера, который их плёл. Фамилия образована по стандартной отческой модели: сначала возникло прозвище Вердник, а затем к нему добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Вердников сын).

Менее распространённая гипотеза связывает фамилию с немецкой фамилией Werdnik, которую могли принести в Россию переселенцы или специалисты, приглашённые при Петре I и Екатерине II. В таком случае корень мог восходить к немецкому «Werde» (становление, развитие) или быть топонимическим — от названия места Вердник в немецкоязычных землях. Однако эта версия слабее: русская словообразовательная модель с суффиксом -ник и окончанием -ов для немецких фамилий нехарактерна. Скорее всего, это переосмысление уже существовавшей русской фамилии под влиянием моды на иностранное звучание.

Географически фамилия Вердников встречается нечасто, но имеет заметный след в Пермском крае и Кировской области — как раз в зоне бытования северорусских говоров, где слово «верда» было в ходу. Суффикс -ник в основе (а не, скажем, -щик) указывает на то, что прозвище закрепилось за человеком не столько по роду занятий, сколько по характерному признаку: «тот, кто имеет дело с вердой». В отличие от фамилий вроде Вершинин (от «вершина»), Вердникова стоит особняком — её корень узко профессиональный и почти забытый.

Однокоренных фамилий в русском языке единицы: Вердников — редкий случай, когда основа не дала множества вариантов. Это говорит о том, что род был немногочисленным и локальным. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или ремесленникам, а не к дворянству — в родословных книгах Вердниковы не значатся.