Фамилия Вергель — одна из тех, где короткое звучание скрывает долгую историю, уходящую корнями в античность. В основе фамилии лежит личное именование Вергель, которое, скорее всего, является сокращённой, обиходной формой древнеримского имени Вергилий. Такое стяжение — типичный для славянской языковой среды приём: длинное иноязычное имя «урезали» до удобного в быту варианта (сравните: Август — Густ, Эмилий — Емеля). Имя Вергилий, в свою очередь, восходит к латинскому virga, что означает «ветвь», «побег», «молодой прут». В переносном смысле это могло указывать на стройного, гибкого человека, но в первую очередь отсылает к знаменитому римскому поэту Публию Вергилию Марону, чьё имя стало нарицательным.

Фамилия образована без дополнительного суффикса — так называемым «нулевым» способом. Модель чистая и прозрачная: прозвище или нецерковное имя Вергель перешло на потомков без изменений, что чаще встречается на западнославянских, украинских и белорусских землях (суффиксальные формы вроде Вергельский или Вергельов встречаются реже). Географически фамилия Вергель сегодня распространена в западных областях Украины (Волынь, Ровенщина), в Беларуси и в южных регионах России, куда могла попасть с переселенцами. Эта привязка к западнорусским территориям косвенно подтверждает версию о прозвищном, а не книжном происхождении: крестьяне и ремесленники вряд ли сами брали себе имя поэта, скорее, так окрестили или прозвали кого-то за глаза, а имя прижилось.

Встречается и альтернативное объяснение, связывающее фамилию с немецким словом Berg (гора) через диалектные варианты, но оно менее убедительно: для славянской ономастики типичнее адаптация личного имени, а не топонима без характерных суффиксов. Версия с Вергилием выглядит предпочтительнее и по звуковому соответствию, и по логике бытового словообразования.