Фамилия Верхоушин — один из тех редких случаев, когда географическое положение предка зашито прямо в корне. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров) или профессий (Кузнецов, Мельников), Верхоушин указывает на место жительства: «верх ушей». Речь не об анатомии, а о топониме.

В основе лежит название реки, ручья или оврага — Уша. Такие гидронимы (названия водных объектов) часто встречаются в северных и центральных областях России. Приставка «верх-» (или «верхо-») в фамилиях и названиях деревень означала «находящийся в верховье»: Верхоушина, Верхоушинский. Человек, получивший такое прозвище, вероятно, жил в деревне, стоящей в верховьях реки Уши, или на Верхоушинском ручье. Модель образования проста: топоним Верхоушино → прозвище Верхоуша → фамилия Верхоушин (с типичным русским суффиксом -ин, указывающим на принадлежность: «чей?» — «сын Верхоуши»).

Суффикс -ин, а не -ов, сам по себе нередкость, но в сочетании с некалендарной основой он выдаёт фамилию старого, допетровского происхождения. В XVI–XVII веках такие «географические» фамилии часто закреплялись за служилыми людьми и крестьянами, которых записывали по месту жительства, а не по имени отца. Сословной принадлежности точно определить нельзя: Верхоушины могли быть как государственными крестьянами, так и детьми боярскими, нёсшими службу в пограничных уездах.

Стоит отметить, что фамилия редкая и узко локальная. Основной ареал — северо-восток европейской части России: Кировская область, Пермский край, Удмуртия. Встречаются варианты написания Верхоушев (с заменой -ин на -ев), но это уже вторичная форма, возникшая под влиянием более распространённой модели на -ов. В метрических книгах XIX века фамилия могла записываться и как Верхоушинъ (с твёрдым знаком на конце).

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Верхоушин стоит в одном ряду с Верховцевым, Верхоланцевым, Верхотиным — все они описывают положение «вверху» относительно какого-то ориентира. Но именно «уши» делают эту фамилию уникальной: она не про слух, а про рельеф, и предок ваш, скорее всего, жил там, где река Уша только начинала свой путь.