Фамилия Верховина — один из тех случаев, когда географическое название перешло в фамилию почти без изменений, но с женским окончанием. Основа здесь — «верховин(а)», то есть верхняя часть чего-либо: верховье реки, возвышенность, горная местность. В русских говорах «верховинка» — это и верхняя часть снопа, и возвышенное место. Прозвище Верховин или Верховня могли дать человеку, который жил на горе, у истока реки или в отдалённом верхнем конце деревни.

Фамилия образована по модели, редкой для русской ономастики. Обычно фамилии на -ин образуются от слов мужского рода на -а/-я (Вершинин от «вершина»), но здесь мы видим основу «Верховина» — слово женского рода. Скорее всего, это не патроним, а топонимическая фамилия: её давали по названию места жительства. В этом плане она близка к фамилиям Заречина, Городина, Дубровина. В украинской традиции фамилия Верховина встречается чаще и может указывать на жителя Верховинского района в Карпатах — там это слово стало почти именем собственным.

У фамилии нет единого дворянского корня. В дореволюционных записях Верховин и Верховинка встречаются в крестьянских и мещанских сословиях, особенно в центральных и южнорусских губерниях, а также на Волыни и в Подолье. Встречается и вариант с ударением на первый слог — Верховина, что меняет значение: так могли называть женщину, дочь или жену человека по прозвищу Верхов.

С точки зрения словообразования, суффикс -ин здесь не столько патронимический (как в фамилиях от имён), сколько притяжательный или топонимический. То есть фамилия отвечает на вопрос «чей?» или «откуда?»: человек с верховья, с горы. В современных базах фамилия нечастотна, но устойчиво встречается в трёх регионах: на Урале, в Поволжье и на Западной Украине, что подтверждает её «верховую» географическую природу.