Фамилия Вифлянцева — женская форма, мужская — Вифлянцев. Это редкая фамилия, и её происхождение неочевидно, но разбор словообразовательной модели и редкой основы даёт ключ к разгадке. Суффикс -ев (а не -ов) указывает на то, что основа исходного прозвища или имени оканчивалась на мягкий согласный или шипящий. Сама же основа «Вифлянц» — почти наверняка искажённое, народное произношение географического названия.

Самая правдоподобная версия: в основе лежит топоним Вифлеем (греч. Βηθλεέμ, церк.-слав. Виѳлеемъ). В русской народной среде, особенно в старообрядческой или крестьянской, это название могли произносить как «Вифлянт» или «Вифлянец», а от него образовать прозвище. Суффикс -ец в прозвищах часто означал «выходец оттуда-то» или «человек, связанный с этим местом». Таким образом, Вифлянец — это человек, получивший прозвище по месту рождения или жительства, связанному с Вифлеемом. Это мог быть либо монах, побывавший в Святой земле, либо крестьянин, живший в селе, названном в честь библейского города (такие названия встречались в южнорусских и украинских землях, например, село Вифлеемка). Прозвище давали и в духовной среде: священнику или причетнику, который служил в храме Рождества Христова или как-то иначе был привязан к библейской географии.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «вихлять» (идти шатаясь, неуклюже). Однако в этом случае фамилия звучала бы как Вихлянцев (от Вихлянец) или Вихляев. Форма «Вифлянцев» с буквой «ф» выдаёт книжное, церковное происхождение, а не чисто бытовое прозвище от глагола. В пользу библейской версии говорит и то, что фамилия встречается в регионах с сильным старообрядческим влиянием (например, на Урале и в Сибири), где библейские имена и названия часто ложились в основу фамилий.

Фамилия Вифлянцева — пример того, как книжное, церковное слово через искажение и переосмысление превратилось в редкое родовое имя. Её носительница — потомок человека, которого в своё время выделили из среды прозвищем, связанным с евангельским городом.