Фамилия Вильчинский — типичный пример того, как географическое название становится родовым именем. В её основе лежит топоним Вильча: так называются несколько посёлков на Украине, особенно в Житомирской и Киевской областях. Человек, переселившийся оттуда, получал прозвище Вильчинский — по месту прежнего жительства. Суффикс -ский в польской и западнорусской традиции как раз и указывает на связь с местностью, а не на отчество.

Сам топоним Вильча, скорее всего, связан с глаголом «вилять» — то есть «кидаться из стороны в сторону, уклоняться от прямого пути». Так могли назвать извилистую речку или дорогу, а за ними — и поселение. Впрочем, не исключено и происхождение от слова «вилы» (развилка, место слияния рек): в славянской топонимике это один из самых частых корней для обозначения излучин и разветвлений.

Фамилия Вильчинский встречается в документах Речи Посполитой с XVII века. Известен дворянский род Вильчинских герба Лис. Один из его представителей, Ольгерд Вильчинский, был записан в Ковенской губернии Вилкомирского уезда — это территория современной Литвы. Как и многие шляхетские фамилии на -ский, она указывала не только на происхождение из конкретного имения, но и на принадлежность к привилегированному сословию. Впрочем, носителями фамилии могли стать и крестьяне, которых записывали по названию деревни, откуда они вышли.

Сегодня фамилия Вильчинский встречается в Польше, Беларуси, на Украине и в России. Вариантов написания два: через «и» (Вильчинский) и через «ы» (Вильчинский) — второй характерен для старой орфографии и польской традиции.