Фамилия Виничек — редкий пример фамилии, образованной не от имени или профессии, а от конкретного бытового предмета, причём с уменьшительно-ласкательным суффиксом. В её основе лежит слово «винок» — так в некоторых южных и западных говорах называли небольшой ручной пресс для отжима сока или масла, либо сам сосуд для вина, бочонок. Суффикс «-ек» указывает на уменьшительную форму, то есть «маленький виноградный пресс» или «небольшой бочонок». Таким образом, прозвище Виничек мог получить либо человек небольшого роста и плотного телосложения (в шутку), либо тот, кто изготавливал или пользовался таким инструментом — винодел, бондарь, маслодел.

Модель образования фамилии — чисто славянская, по типу «прозвище + суффикс принадлежности». Однако здесь нет типичного русского окончания «-ов» или «-ин». Окончание «-ек» — это не патронимический суффикс, а часть самого прозвища. Фамилия застыла в форме именительного падежа единственного числа, что характерно для украинских, белорусских и польских фамилий (сравните: Хлебороб, Коваль, Мельничек). В русской традиции такое прозвище обычно превратили бы в Виничков или Виничкин, но форма Виничек сохранила исходный вид.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям. Она встречается в исторических областях Подолья, Волыни, а также среди потомков переселенцев из этих регионов в Сибирь и на Дальний Восток. В дореволюционных метрических книгах Винички чаще всего записаны как крестьяне или мещане, что неудивительно: ремесло бондаря или мелкое виноделие было распространено именно в сельской местности.

С точки зрения ономастики, фамилия интересна тем, что её корень «вин-» не имеет отношения к латинскому «vinum» напрямую — это общеславянское слово, родственное «вить», «винт», «виноград» (то, что вьётся). В некоторых диалектах «винок» означал не только пресс, но и деревянный кран для бочки. Поэтому версия о происхождении от профессии винодела или бочара — основная. Вторая, менее вероятная, связывает прозвище с польским «winiec» — венок, но для фамилии Виничек это спорно: форма «-ек» нехарактерна для такого корня.

Склоняется фамилия как существительное второго склонения: Виничек, Виничка, о Виничке. Ударение, судя по аналогиям, падает на первый слог: ВИничек.