Фамилия Виницкая в большинстве случаев — это вариант фамилии Винницкая, образованной от названия города Винница в Украине. В старых документах и при устной передаче звук «н» мог выпадать, поэтому написание без двойного «нн» закрепилось как самостоятельный вариант. Такую фамилию чаще всего получали люди, переехавшие из Винницы или её окрестностей в другую местность: их называли «винницкий», то есть выходец из Винницы, а затем это прозвище перешло к детям и внукам как фамилия.

Существует и другая версия, связывающая основу с общеславянским словом «вина». В этом случае фамилия могла закрепиться за человеком, который осознал свою неправоту и раскаялся, — своего рода прозвище «Винившийся». С другой стороны, так могли назвать и того, кто постоянно вызывал подозрения или оказывался виноватым в чужих глазах. Однако эта гипотеза менее правдоподобна: фамилии, образованные напрямую от абстрактного понятия «вина», встречаются реже, чем топонимические (по названию места). К тому же форма на -цк-/-ск- типична именно для географических фамилий: она указывает на принадлежность к местности или городу.

Женская форма Виницкая принадлежит к модели, где окончание -ая указывает на лицо женского пола. Мужской вариант той же фамилии — Виницкий. Встречается фамилия преимущественно в западных и центральных регионах России, на Украине и в Беларуси, что подтверждает её связь с Винницей.