Фамилия Винидиктова — женская форма фамилии Винидиктов, которая образована от мужского имени Винидикт. Это имя — народная, разговорная переделка церковного имени Венедикт. В основе латинское benedictus — «благословенный». В русской традиции имя Венедикт давали при крещении, а в быту оно могло звучать как Винидикт, особенно в южнорусских и украинских говорах, где «е» переходило в «и» под ударением, а «д» перед «и» смягчалось.

Словообразовательная модель проста: к основе имени добавили патронимический суффикс -ов-, означающий «сын Винидикта». Затем, для женской формы, прибавили окончание -а. Фамилия типична для русской крестьянской и мещанской среды XVII–XIX веков: такие фамилии на -ов/-ев получали крестьяне после отмены крепостного права, часто по имени отца или деда. Значит, предок носительницы фамилии — человек по имени Винидикт, скорее всего, простого звания.

Отдельного внимания заслуживает редкая основа. В отличие от массовых Ивановых или Петровых, имя Венедикт (а тем более его народная форма) встречалось нечасто. В святцах оно есть, но популярностью не пользовалось. Поэтому Винидиктовы — фамилия малочисленная, сконцентрированная в центральных и южных губерниях России, особенно в Курской, Воронежской и Тамбовской областях. Если искать однокоренные варианты, то это Венедиктов (от полной формы) и Винидиктов (без суффикса -ов), но последний — скорее исключение.

В дореволюционных переписях фамилия могла писаться через «е» — Венедиктова, если чиновник исправлял народное произношение на книжное. Но в метрических книгах крестьян чаще фиксировали именно Винидиктова, как слышали. Таким образом, носительница этой фамилии может с высокой долей вероятности проследить свои корни до крестьянина Винидикта, жившего в Черноземье или на юге России не позднее начала XVIII века.