Фамилия Винидиктов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Винидиктов послужило церковное имя Венедикт. Фамилия Винидиктов является фонетическим вариантом фамилии Венедиктов, восходящей к мужскому имени Венедикт. Оно происходит от латинского benedictus и переводится на русский язык как «благословенный», «тот, о ком хорошо говорят». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Венедикт, со временем получил фамилию Винидиктов. О точном месте и времени возникновения фамилии Винидиктов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Винидиктов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.