Фамилия Вишнигин не самая простая для разбора, и в этом её интерес. На первый взгляд кажется, что в основе лежит слово «вишня» — ягода, дерево. Однако если присмотреться к суффиксу, то сразу появляется сомнение: от «вишня» мы ожидали бы фамилию Вишнягин или Вишнёгин, но никак не Вишнигин. Гласный «и» в корне и суффикс «-игин» — довольно редкое сочетание, которое указывает на другой путь образования.

Скорее всего, перед нами вариант фамилии, образованной от прозвища или имени Вишнига. В русских говорах слово «вишняк» означало «вишнёвый сад», а «вишнига» могло быть прозвищем человека, который жил у такого сада или торговал вишней. Суффикс «-ига» в русских прозвищах встречался (сравните с фамилиями Шумига, Калига), он придавал слову оттенок просторечия или принадлежности к определённой местности. Таким образом, Вишнига — это человек, связанный с вишней: садовод, торговец или просто обладатель характерной внешности (например, румяный, как вишня).

Другая, менее вероятная версия — связь с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слово «вишня» (в заимствованной форме), но суффикс «-гин» там тоже встречается. Однако для русской фамилии такая модель нетипична, и географическое распространение Вишнигиных (по доступным данным, фамилия встречается в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской и Тамбовской) скорее говорит о славянской основе.

Суффикс «-ин» в конце фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Вишнигин, то есть сын или потомок Вишниги. Это типичная русская патронимическая модель, только в роли отчества выступает не крестильное имя, а прозвище. Фамилия недворянская, скорее крестьянская или мещанская, что подтверждается её редкой, «земляной» основой без книжных или церковных корней.

В итоге: Вишнигин — это «вишнёвый человек», потомок того, кого в деревне прозвали за любовь к вишне или за жизнь при вишнёвом саде. Фамилия сохранила редкую словообразовательную форму, которая отличает её от более распространённых Вишняковых и Вишнёвых.