Фамилия Водягин ведет начало от прозвища Водяга. В его основе лежит нарицательное «вода», а сама фамилия образована с помощью типичного для русских фамилий суффикса принадлежности -ин, который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на родство: Водягин — «сын Водяги» или «человек из семьи Водяги».

Прозвище Водяга, скорее всего, относилось к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род занятий. Логично предположить, что основатель рода Водягиных был рыбаком, мореходом, лодочником или жил у большой воды. В русских говорах «водягой» могли назвать водяного духа или человека, который постоянно возится с водой, — это подтверждает бытовое, а не мифологическое происхождение прозвища.

Однако в славянской мифологии вода — одна из основных стихий мироздания, опора земли, источник жизни и средство магического очищения. Очистительная символика воды раскрывается во многих обрядах: хождение за водой, внесение ее в дом, обливание людей и построек, умывание «новой» водой, заговаривание воды для лечения. Поэтому не исключено, что в прозвище Водяга предки вкладывали особый символический смысл, называя так человека, связанного с обрядами или почитаемого за связь с этой стихией.

Фамилия довольно редкая. Ее можно встретить в центральных и северных регионах России, где промыслы на реках и озерах были основой жизни. Интересно, что однокоренные фамилии — Водянов, Водин, Водяников — образованы от разных вариантов того же корня, но Водягин выделяется суффиксом -яг-, который в русских прозвищах часто придавал слову оттенок просторечия или ласкательности (ср. бедняга, миляга). Это делает фамилию не просто указанием на профессию, а личным, «домашним» прозванием, которое закрепилось за родом.