Фамилия Водякова — женская форма, а мужская, Водяков, в свою очередь, происходит от прозвища или нецерковного имени Водяк. Основа здесь прозрачна: «вода». Но что именно стояло за этим прозвищем, не так однозначно, как кажется на первый взгляд.

Самое прямое объяснение — человек, чья жизнь или работа были тесно связаны с водой. Водяком могли назвать лодочника, перевозчика, рыбака, мельника или того, кто жил у реки и промышлял водным промыслом. Однако в русских говорах слово «водяк» имело и переносные, порой нелестные значения. В некоторых регионах так говорили о водянистом, пустом на вкус арбузе или о человеке бледном, болезненном, словно «водяном». Есть и более редкая версия: «водяк» — это водяной дух, леший, обитающий в омутах, но вряд ли родители нарекли бы ребёнка таким именем намеренно. Скорее, прозвище закрепилось за кем-то со странностями или за тем, кого считали «не от мира сего».

Модель образования типична для северных и центральных русских земель: суффикс -як указывал на принадлежность к чему-либо (ср. рыбак, моряк, сибиряк). Затем к основе Водяк добавился патронимический суффикс -ов, и сын Водяка стал Водяковым. В документах фамилия встречается с XVII века, в основном в Вятской, Пермской и Архангельской губерниях — в краях, где реки были главными дорогами. Сравните с однокоренными Водягин, Водянов, Водопьянов — все они из того же водного гнезда, но Водяков выделяется именно прозвищной, а не топонимической основой.

Никакого дворянского или крестьянского сословного ярлыка на фамилии нет: Водяковыми могли быть и государственные крестьяне, и посадские люди. Сегодня фамилия редкая, но не исчезнувшая — её носители живут в Поволжье и на Урале, сохраняя память о предке, чья жизнь когда-то текла у воды.