Фамилия Волынкина образована от прозвища Волынка. В основе лежит слово «волынка» — народный духовой инструмент из нескольких трубок, вделанных в кожаный мешок. Но прозвище давали не музыкантам. Дело в переносном значении: выражение «тянуть волынку» означало медлить, канителиться. Так могли назвать нерасторопного или нарочито медлительного человека.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «Волынкин», то есть сын или потомок Волынки. Форма Волынкина — женский вариант или исходная форма в родительном падеже (в официальных документах XIX века нередко писали «жена Волынкина»).

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от мужских имен на согласный, суффикс -ин характерен для основ на -а/-я. Поэтому Волынкина — не исключение, а регулярная модель. Сравните с однокоренными фамилиями: Волынков (от той же основы, но с другим суффиксом) и Волынский (топонимическая, от названия исторической области Волынь). Волынкина с ними не связана — её корень именно прозвищный, а не географический.

Фамилия встречается в разных регионах, но заметна концентрация в центральной России и Поволжье. В переписных книгах XVII–XVIII веков Волынкины упоминаются среди крестьян и посадских людей — сословного барьера для такого прозвища не было. Прозвище Волынка давали и крестьянину, и ремесленнику, и служилому человеку, если он отличался медлительностью.

Точных сведений о дворянских ветвях Волынкиных нет. В родословных книгах эта фамилия не значится, что подтверждает её происхождение из непривилегированных слоёв.