Фамилия Ворникова — женская форма, образованная от мужской фамилии Ворников, которая, в свою очередь, восходит к прозвищу Ворник. В основе этого прозвища лежит не столько обиходное русское слово, сколько исторический термин, имеющий конкретное социальное значение. Ворником в Молдавском княжестве и Валахии называли высшего сановника, управляющего господарским двором, который выполнял административные, судебные и военные функции в отсутствие господаря. Таким образом, предок носителей фамилии мог быть либо выходцем из этих земель, либо человеком, получившим такое прозвище за сходство с должностным лицом — за распорядительность, властность или организаторские способности.

Менее вероятная, но популярная в народной этимологии версия связывает прозвище Ворник с нарицательным «ворон». Согласно этой гипотезе, прозвище могло указывать на внешность (черные, как вороново крыло, волосы) или на качества, приписываемые этой птице у славян: мудрость, долголетие, зоркость. В старину такие «птичьи» прозвища действительно давали как мирские имена, чтобы оградить ребенка от сглаза или передать ему свойства тотема. Однако в случае с фамилией Ворникова первая версия — профессиональная, связанная с управленческой должностью — выглядит исторически более обоснованной и точной, так как слово «ворник» как титул зафиксировано в документах, тогда как форма «Ворник» от «ворон» встречается реже и обычно имеет иную суффиксацию (Воронов, Воронков).

Фамилия Ворникова — сравнительно редкая, что говорит о локальном происхождении рода. Скорее всего, её корни следует искать на юго-западных рубежах России или в среде переселенцев из Молдавии, где титул «ворник» был широко распространен. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий по принадлежности: «чей?» — Ворников, то есть сын Ворника. Со временем, когда прозвище перестало быть актуальным, оно закрепилось как наследственное родовое имя, и сегодня фамилия Ворникова хранит память о социальном статусе или характерной черте своего далекого основателя.