Фамилия Воронуха — редкий пример, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, минуя типовые суффиксы -ов, -ин или -ский. Сама основа «ворон» сразу указывает на птицу, но в данном случае перед нами не просто сравнение с чёрной птицей, а скорее прозвище, образованное с помощью суффикса -ух(а). Этот суффикс в восточнославянских говорах придавал слову оттенок грубоватости, просторечия или даже уничижительности: ср. «грязнуха», «толстуха», «воронуха» — то есть не просто ворон, а нечто вороноподобное, либо человек с соответствующими чертами.

Вероятнее всего, Воронухой называли человека за внешность (тёмные волосы, смуглую кожу) или за манеру поведения — например, за вороноватость, рассеянность или склонность к воровству (в народе ворону часто связывали с плутовством). Есть и вторая версия, менее очевидная: на Русском Севере и в Сибири «воронуха» — диалектное название некоторых растений, например, вороньего глаза или чемерицы. Прозвище мог получить травник, знахарь или человек, живший рядом с местом, где росла такая трава.

Суффикс -уха активно использовался в украинских и белорусских землях, что указывает на возможное западнорусское или малороссийское происхождение фамилии. В документах фамилия фиксируется с XVII века: в реестрах запорожского казачества встречаются прозвища Воронуха, которые потом закреплялись за потомками. В центральной России эта модель менее типична — там чаще образовывали фамилии через -ин (Воронин) или -ов (Воронов).

Таким образом, Воронуха — не переосмысленная фамилия, а прямое прозвище, которое закрепилось в форме именительного падежа. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были людьми из простонародья — крестьянами или казаками, получившими меткое уличное имя, которое со временем стало официальным.