Фамилия Воронухина — женская форма мужской фамилии Воронухин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Воронуха. Разберём цепочку по косточкам: корень «ворон-» указывает на птицу, суффикс «-ух(а)» — интересная деталь, которая сразу выводит фамилию из ряда простых «птичьих».

В русской ономастике суффикс «-уха» — активный словообразовательный элемент для прозвищ. Он придаёт основе оттенок характерности или даже некоторой грубоватости. Сравните: Ворон — просто птица, Воронуха — уже нечто вроде «чернявый», «вороной» или человек с чёрными, как вороново крыло, волосами. В говорах слово «воронуха» могло означать и растение (вороний глаз, например), и смуглую женщину, но прозвище чаще давали мужчине по внешности: темноволосому, смуглому, возможно, угрюмому или молчаливому, по ассоциации с птицей.

Модель образования — типично русская, с патронимическим суффиксом «-ин». Фамилии на «-ин» образовывались от основ на -а, -я: Воронуха → сын Воронухи → Воронухин. То есть предок носителя фамилии — человек по прозвищу Воронуха. В отличие от фамилий на «-ов» (от основ на согласный), здесь нет указания на «принадлежность барину»; это фамилия крестьянская или посадская, каких большинство в центральной России.

Географически фамилия Воронухин (и Воронухина) — редкая, не массовая. Встречается точечно, преимущественно в Поволжье и на Урале, что может говорить о миграции носителей прозвища в XVII–XVIII веках. Словарь Б. Унбегауна относит подобные модели к «полуименам» — бытовым формам, которые закрепились как фамилии, минуя стадию полного христианского имени.

Любопытная деталь: в некоторых регионах «воронуха» — не только прозвище человека, но и народное название гриба-сморчка или черники. Однако версия с прозвищем по внешности надёжнее: ономастический принцип «от птицы к человеку» работает чаще, чем «от растения». Так что предок Воронухиных, скорее всего, был просто чернявым парнем, за которым закрепилось уличное имя — и оно пережило века в виде фамилии.