Фамилия Войтищор — редкая и географически привязанная к западнорусским землям, скорее всего, к территории современной Беларуси или западных областей Украины и Польши. Её разбор стоит начать с корня. Основа «Войт» — это не славянское имя, а заимствование из немецкого «Vogt» (управляющий, наместник). В Речи Посполитой войтом называли выборного или назначенного главу сельской общины, иногда — городского судью. Это административная должность, аналог старосты. Второй элемент «-ищор» — сложный суффикс, который встречается в польской и белорусской ономастике. Он образован от суффикса принадлежности «-ич» (сын) и уменьшительного «-ор»: Войтищор буквально значит «сын Войта», причём не самого войта, а, возможно, его младшего или незнатного потомка. Или же это прозвище, данное человеку, который работал на войта или жил в его усадьбе.

Словообразовательная модель здесь нестандартная для великорусских фамилий, которые чаще заканчиваются на -ов или -ин. Формант «-щор» — это искажённое польское «-szczur» (ср. фамилии Войцещук, Войтищук). Вероятно, первоначальная форма звучала как Войтищур или Войцещук, но под влиянием местного произношения «у» перешло в «о», а «щ» закрепилось как «щ». Такое смешение типично для пограничья, где встречаются польские, белорусские и украинские говоры.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мелкой шляхте. Войты, хоть и были начальниками, редко принадлежали к высшей знати. Их дети, получая прозвище по отцовской должности, со временем закрепляли его как фамилию. Если искать аналоги, то фамилия Войтищор стоит в одном ряду с Войтович, Войцеховский, Войтенко — все они указывают на связь с должностью или именем Войт, но Войтищор отличается редким суффиксом, который не даёт перепутать её с массовыми фамилиями. В современной России она практически не встречается, что подтверждает её локальное происхождение — скорее всего, из Гродненской или Брестской области, где веками жили польско-белорусские крестьяне.