Фамилия Вратский — одна из тех, где сразу видна географическая основа. Её ядро — слово «врата», то есть ворота. В славянской топонимике «Врата» или «Вратце» нередко обозначали ущелье, теснину, горный проход — природные «ворота». Соответственно, Вратский — это тот, кто родом из места с таким названием. В Чехии, Словакии и на Балканах существует немало селений Вратиславице, Вратна или просто Врата; от них и пошли фамилии на -ский, указывающие на выходца.

Интересно, что в русской традиции фамилия встречается редко. Если она и возникла на территории России, то, скорее всего, как семинарская. В духовных училищах ученикам нередко давали фамилии по церковным праздникам или понятиям, и «Вратский» могло быть связано с образом «врат небесных» или «царских врат» в иконостасе. Однако такая версия менее вероятна, чем топонимическая: суффикс -ский в русских фамилиях чаще указывает на владельческий или географический признак, а не на прямое отношение к предмету.

По словообразовательной модели фамилия близка к польским и украинским аналогам типа Вротский, Вратович. В польском языке «wrota» — те же ворота, и фамилия могла появиться у человека, жившего у городских ворот или занимавшегося их охраной. Но для варианта Вратский с твёрдым «в» и сохранённым корнем более характерна чешская или словацкая среда, где слово «vrata» произносится именно так.

Сословная принадлежность носителей фамилии не прослеживается однозначно. В XIX веке Вратские могли быть как крестьянами, переселившимися из западных губерний, так и выходцами из духовенства. В любом случае, фамилия звучит как указание на происхождение: предок человека с фамилией Вратский когда-то пришёл из-за «врат» — горного прохода или села с похожим именем.