Фамилия Вышатко звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Её происхождение почти наверняка связано с украинским или белорусским языком, а не с великорусскими говорами. На это указывает суффикс -ко, который в восточнославянских фамилиях характерен именно для запада — для Украины, Беларуси и южных областей России, граничащих с ними. В польском языке этому суффиксу соответствует -ка, что делает фамилию частью большой группы «уменьшительных» прозвищ, которые со временем закрепились как родовые имена.

Основа фамилии — «Вышат». Это не календарное имя, а древнерусское прозвище или нецерковное имя. Корень «выш-» прямо указывает на значение «высокий», «вышний». Можно предположить, что прозвище Вышат дали человеку высокого роста. Однако в древнерусском языке было и личное имя Вышата, которое встречается в летописях. Например, в XI веке известен воевода Вышата, сын Остромира, новгородского посадника. В этом случае имя могло иметь не столько описательное, сколько пожелательное значение — «возвышенный», «высокий духом». Фамилия Вышатко, таким образом, означает «потомок Вышаты» или «маленький Вышата» (в уменьшительно-ласкательном значении).

Написание фамилии через «о» на конце — «Вышатко» — для русского языка нетипично. В русских фамилиях на -ко чаще встречается окончание -ов (Вышатков), которое «обрусело» бы фамилию. Сохранение формы Вышатко говорит о том, что носители фамилии долгое время жили в среде, где украинская или белорусская модель словообразования была нормой, и фамилия не прошла через канцелярскую русификацию. Встречается также вариант Вышатка, который фонетически близок и мог возникнуть в результате записи фамилии на слух.

В сословном отношении носители фамилии Вышатко, скорее всего, были крестьянами или казаками. Фамилии на -ко в массе своей закрепились именно в этих слоях населения, в отличие от дворянских фамилий, которые чаще имели суффиксы -ов/-ев или -ский. Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Полтавской, Киевской областям, а также к Гомельской области Беларуси. В России она встречается реже и, как правило, у потомков переселенцев с Украины.

Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Вышеславцев, Вышемирский или Вышков, показывает разницу в социальном происхождении: первые две — книжные, семинарские или дворянские, а Вышатко — народная, прозвищная. Это не делает её менее ценной для истории — напротив, она сохранила живую народную речь и древнюю антропонимическую модель в её исходном виде.