Фамилия Выскребцева образована от прозвища Выскребец. Скорее всего, оно ведет свое начало от глагола «выскребывать» — «отделять, вынимать, чистить скребя, скобля». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Выскребцевых занимался чисткой, обработкой чего-либо. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Выскребец, со временем получил фамилию Выскребцева.