Фамилия Выскубин — редкая и неочевидная с точки зрения корня. Если не знать диалектной лексики, можно заподозрить в ней что-то иноязычное или искусственное, но на самом деле её происхождение прозрачно и связано с русским Северо-Западом.

В основе лежит слово «выскуб» или глагол «выскубать» — так в псковских и тверских говорах называли ощипывание птицы, выдёргивание перьев. Соответственно, прозвище Выскуба могли дать человеку, который занимался этой работой: либо птичнику, либо тому, кто обрабатывал тушки перед готовкой. Но возможен и переносный смысл: «выскуба» — придирчивый, дотошный человек, который «выщипывает» мелочи, не даёт прохода.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Выскубин — «сын Выскубы». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я (ср. Губин, Сорокин). Модель древняя, но сама фамилия, скорее всего, оформилась не раньше XVI–XVII веков, когда прозвища начали закрепляться за потомками.

Географически фамилия тяготеет к северо-западным областям России — Псковской, Новгородской, Тверской. В центральных и южных регионах она почти не встречается, что подтверждает диалектную природу основы. Встречаются варианты написания с одной «с» — Выкубин, но это уже искажение, потерявшее исходную приставку вы-.

Любопытно, что у фамилии нет очевидных «двойников» в других славянских языках. Это чисто русское образование, не имеющее параллелей в украинской или белорусской ономастике. Так что если вы Выскубин, ваши предки почти наверняка жили на северо-западе России и занимались либо птицеводством, либо отличались скрупулёзным характером — или и тем, и другим сразу.