Фамилия Высоковский происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Скорее всего, фамилия Высоковский восходит к топониму Высоково — села с таким названием встречаются повсеместно на всей территории Российской Федерации (например, в Вачском районе Нижегородской области, Борисоглебском районе Ростовской области, Селивановском районе Владимирской области, В Московской области и др. Вероятно, предок обладателя фамилии Высоковский был уроженцем одного из населенных пунктов с подобным названием. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит прозвище Высокий, которое образовано от аналогичного прилагательного и указывает на внешние особенности предка — на его высокий рост. Менее вероятно, что Высоким прозвали человека, который занимал какую-либо руководящую должность, то есть того, кто «довысился до больших чинов». О точном месте и времени возникновения фамилии Высоковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Высоковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.