Фамилия Яготин происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Яготин образована от топонима Яготин. Так называется город в Киевской области Украины, расположенный на берегу реки Супой. Город основан в 1552 году. Однако окрестные земли были заселены уже во времена Киевской Руси. Первое историческое свидетельство о гидрониме Супой встречается в знаменитой летописи «Повесть временных лет» за 1085 год (в «Поучении Владимира Мономаха своим сыновьям».) Второе летописное упоминание поселений на реке Супой относится к 1136 году. Но после татаро-монгольского нашествия эти земли были опустошены и долгое время не заселялись. Существует множество версий происхождения топонима Яготин. По одной из легенд, это название будто бы имеет происхождение от крымских татар, которые были разбиты казаками на Супое в районе Яготина. Татарский мурза Яга был взят в плен и содержался казаками в укрепленном лагере на полуострове, который вытянулся в Супой (теперь Пидварки). Отсюда и название «Яго-тино» - Яга в плену. Вероятно, основатель фамилии Яготиных родился или долгое время жил в этом населенном пункте. Поскольку топонимические фамилии содержали указание не только на принадлежность к конкретной семье, но и на отношение к определенному географическому объекту, то изначально они представляли собой прилагательные с различными формантами: фамилии на – ский /-цкий и –анинов /-янинов принадлежат в основном знати и дворянству; фамилии на –итов /-ичев, -инов, -цев, - яков /-аков, - ников, -ин, -их /-ых, -ин - представителям всех остальных сословий. Фамилия Яготин встречается в различных исторических документах. Так, в Книге памяти Омской области упоминается крестьянин Яготин Сергей Никандрович, родившийся в 1881 году в деревне Бугаевка Омского района Сибирского края. О точном месте и времени возникновения фамилии Яготин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Яготин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.