Фамилия Яготина образована от топонима Яготин — город в Киевской области Украины, расположенный на берегу реки Супой. Город основан в 1552 году. Однако окрестные земли были заселены уже во времена Киевской Руси. Первое историческое воспоминание Супоя встречается в знаменитой летописи «повесть временных лет» за 1085 г. (в «Поучении Владимира Мономаха своим сыновьям».) Второе летописное упоминание относится к 1136 году. Но после татаро-монгольского нашествия эти земли были опустошены и долгое время не заселялись. Существует множество версий происхождения топонима Яготин. По одной из легенд, это название будто бы имеет происхождение от крымских татар, которые были разбиты казаками на Супое в районе Яготина. Татарский мурза Яга был взят в плен и содержался казаками в укрепленном лагере на полуострове, который вытянулся в Супой (теперь Пидварки). Отсюда и название «Яго-тино» - Яга в плену. Вероятно, основатель фамилии Яготиных родился или долгое время жил в этом населенном пункте. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Яготин, со временем получил фамилию Яготина.