Фамилия Ягудкин — редкая, и её значение напрямую зависит от того, какой корень считать основным. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), а основа — личное имя или прозвище Ягудка. Но что такое «Ягудка»?

Самый очевидный путь — от слова «ягода», но с уменьшительным суффиксом -к-. Однако в русских говорах известна и форма «ягудка» (ягодка), и прозвище Ягода, которое давали человеку маленького роста, румяному или любителю ягод. В этом случае Ягудкин — потомок человека по прозвищу Ягудка.

Вторая версия — от крестильного имени. В старину бытовало редкое имя Ягуда (вариант библейского Иегуда, Иуда). Уменьшительная форма Ягудка звучит естественно: так в быту звали человека, которого в церковных записях числили Иудой. Поскольку имя Иуда после евангельской истории стало неблагозвучным, в народе его старались заменять на Ягуда, а в быту — на Ягудку. Фамилия Ягудкин тогда означает «сын Ягудки».

Третий, менее вероятный вариант — от тюркского слова «ягут» (драгоценный камень, рубин) или от еврейского имени Ягуда (ивр. «восхваляющий»). Но для русской фамилии с суффиксом -ин это нетипично: основа «Ягут» дала бы Ягуткин, а не Ягудкин. Поэтому версия с ягодой или с именем Иуда выглядит убедительнее.

Географически фамилия встречается в центральных областях России, но крайне редко. В дореволюционных документах её носители — крестьяне и мещане. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Ягудкин не упоминается, что подтверждает её локальный и нетипичный характер.