Фамилия Яхонова — женская форма фамилии Яхонов, и её происхождение связано с редким, но ярким словом «яхонт». В древнерусском языке яхонтом называли драгоценный камень, чаще всего рубин или сапфир. Само слово пришло из греческого через посредство арабского, но в русской культуре оно закрепилось как поэтическое обозначение чего-то драгоценного, сияющего.

Однако напрямую выводить фамилию из названия камня было бы поспешно. Скорее всего, в основе лежит прозвище Яхонт, которое могли дать человеку за красивую внешность, дорогой наряд или особую стать. В старину прозвища такого типа были метафорическими: например, Золото, Серебро или Жемчуг. Человек, которого называли Яхонтом, мог быть любимцем в семье или обладать редкими душевными качествами — отсюда и сравнение с самоцветом.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -ов- указывает на принадлежность («чей сын?» — Яхонтов). Таким образом, Яхонов — это потомок человека по прозвищу Яхонт. Форма Яхонова, соответственно, означает «дочь или жена Яхонова». Фамилия встречается в центральных регионах России, особенно в старых купеческих и мещанских родах, где было принято давать «драгоценные» прозвища.

Интересно, что в некоторых говорах «яхонт» могло звучать как «яхон» или «яхонт» с выпадением конечного «т», что и дало вариант Яхонов, а не Яхонтов. Хотя форма Яхонтов тоже существует, она встречается реже. Так что фамилия Яхонова — это не про камень как таковой, а про прозвище, которое когда-то выделяло человека среди других, как драгоценный камень среди простых.