Вероятно, фамилия Яхонина образована от имени Яхоня — краткой формы древнееврейско-арабского имени Яхъя, которое в переводе означает «воодушевляющий, вдохновляющий». Это имя представляет собой вариант древнееврейского имени Иоанн. Апостол любви — так именуется святой Иоанн, поскольку он заповедовал всем христианам любить Господа и друг друга и этим исполнить закон Христов. Сведения о представителях фамилии Яхонины встречаются в различных архивных документах. Так, в Книге памяти Нижегородской области упоминается Яхонин Федор Иванович, который родился в 1890 году и был начальником отдела снабжения завода «Гудок Октября».