Фамилия Яхшиев — редкий пример, когда основа фамилии не просто прозвище или имя, а целая характеристика, данная человеку. В её основе лежит тюркское слово «яхши» (иногда «якши», «яхшы»), которое в большинстве тюркских языков (татарском, башкирском, каракалпакском, крымскотатарском, узбекском) означает «хороший», «добрый», «отличный». Это не имя в привычном понимании, а прозвище, которое мог получить человек с положительными качествами: добрый, умелый, надёжный. В тюркской среде такие «качественные» прозвища были распространены — ими награждали за характер или мастерство.

Суффикс -ев указывает на русскую модель оформления фамилии, что типично для многих народов Поволжья, Кавказа и Средней Азии, попавших в орбиту Российской империи. Фамилия образована по принципу «чей?»: Яхшиев — сын (или потомок) Яхши. То есть сначала было личное прозвище Яхши, которое закрепилось за главой семьи, а затем, при переходе на фамилии, к нему добавили русский патронимический суффикс. Интересно, что в тюркской среде слово «яхши» могло быть и частью составного имени, например, Яхшибай (хороший богач) или Яхшигерей, но в данном случае фамилия образована именно от самостоятельной формы.

Географически фамилия Яхшиев встречается не повсеместно. Основной ареал — регионы с тюркским населением: Татарстан, Башкортостан, Казахстан, а также среди карачаевцев и балкарцев. Встречается и у народов Дагестана, где слово «яхши» также знакомо, но чаще в форме «яхшиев» фиксируется у ногайцев и кумыков. При этом фамилия остаётся достаточно редкой — в общероссийских базах она не входит в сотни самых частых.

Стоит отметить, что в отличие от фамилий, образованных от арабских или персидских имён (которые часто имеют религиозный подтекст), Яхшиев — это «бытовая» фамилия. Она не несёт отсылок к исламу или знатности, а прямо говорит о том, что предок носителя фамилии слыл человеком положительным, «хорошим» в глазах окружающих. В словаре тюркских фамилий (например, в работах А. Суперанской) такая модель квалифицируется как прозвищная, перешедшая в фамилию без изменений основы.