Фамилия Яхудин — редкий пример, где корень не сразу бросается в глаза, а написание может ввести в заблуждение. На первый взгляд кажется, что основа — «Яхуд», но на самом деле это адаптация арабского имени Яхья (арабская форма библейского Иоанна) через татарскую или башкирскую языковую среду.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ на -а, -я: Яхуд(а) + ин = Яхудин. Но исходное имя в тюркских диалектах звучало как Яхут или Яхуд — это диалектные варианты того же Яхьи. Переход «т» в «д» перед гласным (Яхуд-ин) для тюркской фонетики естественен, а на письме закрепился именно звонкий вариант.

Географически фамилия почти целиком привязана к Волго-Уральскому региону: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Встречается у татар и башкир, реже — у мишарей. Сословно носители чаще всего были государственными крестьянами или тептярами (сословие, платившее ясак), то есть не дворянами, но и не крепостными. Фамилия не имела аристократического оттенка и фиксировалась в метриках с середины XIX века, когда у нерусских народов массово появились наследственные фамилии.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом яхут (драгоценный камень, яхонт). Но против неё говорит то, что прозвища по драгоценным камням в тюркской среде почти не встречались, а вот библейские имена через ислам — обычное дело. Поэтому антропонимический корень (от имени Яхья) убедительнее.

Редкость фамилии (в России её носят меньше тысячи человек) объясняется тем, что она не вышла за пределы узкого ареала и не «растворилась» в более массовых фамилиях вроде Яхин или Яхъев. Если ваш предок — Яхудин, он почти наверняка был татарином-мусульманином из прикамских или приуральских деревень, а его далёкий тёзка носил имя в честь пророка Яхьи (Иоанна Крестителя в исламской традиции).