Фамилия Яковюк — характерный пример западноукраинской модели образования фамилий. Её основа — каноническое имя Яков, а суффикс -юк указывает на происхождение с территории Волыни, Галичины, Подолья или Полесья. В этих регионах суффикс -юк выполнял ту же роль, что в восточнославянских землях -ов/-ев или -ин: он означал «потомок», «сын» или «маленький». То есть Яковюк — это буквально «сын Якова» или «Яковлев».

Имя Яков пришло на Русь вместе с христианством из древнееврейского языка, где оно звучало как Яаков и означало «держащийся за пятку» или «следующий по пятам». По библейскому сюжету, так назвали близнеца Исава, который родился, держась за его пятку. В просторечии имя обросло множеством форм: Яша, Яшка, Яцек, Якуб, и именно от последнего варианта (через польское влияние) могла возникнуть фамилия Яковюк. В польской традиции имя Jakub давало фамилии типа Jakubiak, Jakubczyk, а украинский аналог с суффиксом -юк закрепился как Яковюк.

Географически фамилия Яковюк наиболее плотно представлена на западе Украины — в Ровенской, Волынской, Хмельницкой областях. Встречается она и в Беларуси, особенно в Брестской области, что объясняется исторической миграцией и общими моделями фамилеобразования в пограничных регионах. В России фамилия редка и, как правило, принадлежит потомкам переселенцев с Украины.

С точки зрения социального контекста, фамилии на -юк в массе своей принадлежали крестьянскому и казацкому сословию. Дворянство в этих землях чаще носило фамилии на -ский/-цкий. Поэтому предки Яковюков, скорее всего, были свободными земледельцами или казаками, а не шляхтой. Важно и то, что суффикс -юк в украинской ономастике считается одним из самых продуктивных — он дал тысячи фамилий (Бондарюк, Ковалюк, Гнатюк), и Яковюк стоит в этом ряду как типичный патроним.

В написании фамилии возможны варианты: Яковюк, Яковюк (с ударением на последний слог) или, реже, Яковюк (с ударением на «ю»). В документах XIX века, особенно в метрических книгах, встречалась форма Яковюкъ. Сегодня фамилия не имеет спорных корней или альтернативных версий происхождения — всё прозрачно упирается в имя Яков и региональный суффикс.