Фамилия Якубек — яркий пример того, как географический фактор меняет облик привычного имени. Её основа — каноническое мужское имя Якуб, восточноевропейский аналог библейского Иаков (в русской традиции — Яков). Но ключевую роль играет не корень, а суффикс: -ек.

В славянском мире фамилии на -ек характерны прежде всего для чешского, словацкого и польского языков. Если в России фамилии чаще образовывали с помощью суффиксов принадлежности (-ов, -ин) или уменьшительных (-енко, -ук), то в западнославянской традиции -ек — типичный патронимический суффикс, означающий «маленький», «сын» или «потомок». То есть Якубек — это «маленький Якуб» или, по сути, «Якубов сын». Такая модель нехарактерна для русской ономастики, поэтому носители фамилии Якубек, скорее всего, имеют предков из Чехии, Словакии, южной Польши или из числа переселенцев из этих регионов в Российскую империю.

Второй, менее вероятный, но возможный вариант — немецкое происхождение. В немецком языке суффикс -ек встречается в фамилиях, адаптированных из славянских языков, особенно на востоке Германии (Силезия, Померания), где веками жило смешанное население. Немецкий Jakobek мог появиться как запись чешской или польской фамилии на слух.

Интересно, что в отличие от русских фамилий на -ов, которые «застывают» в форме притяжательного прилагательного (чей? — Яковлев), фамилия Якубек сохраняет живую уменьшительную форму. В чешской среде она до сих пор воспринимается как прозвище или неофициальное именование, а в России стала полноценной наследственной фамилией. Поиск по архивам показывает, что в дореволюционной России Якубеки встречались в Царстве Польском, в западных губерниях и среди чешских колонистов, например, на Волыни, куда в XIX веке переезжали целыми общинами.