Фамилия Якубишин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Якубишин послужило церковное имя Якубиша. Имя Якубиша является уменьшительной формой мужского крестильного имени Иаков, которое в переводе с древнееврейского означает «второй по рождению». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якубиша, со временем получил фамилию Якубишин. О точном месте и времени возникновения фамилии Якубишин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Якубишин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.