Фамилия Якубкин относится к распространенному типу еврейских фамилий. Имя Якуб является одной из форм крестильного мужского имени Яков. Очевидно, Якубка - русский уменьшительный вариант этого имени. Имя Яков (Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Все это свидетельствует о том, что фамилия Якубкин представляет собой замечательный памятник европейской письменности и культуры. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения фамилии Якубкин можно лишь на основании генеалогических исследований.